在《金版口袋怪兽》中，道馆挑战是玩家成长旅程的重要组成部分，也是检验训练家实力的关键环节。玩家需要依次击败八位道馆馆主，获得徽章后才能挑战联盟。每个道馆都有其独特的属性、训练家配置以及最终挑战的馆主，因此掌握每个道馆的通关技巧至关重要。
玩家应从尼比市的岩石属性道馆开始挑战。馆主小刚擅长使用岩石系宝可梦，如小拳石与隆隆岩。由于岩石系容易被水系、草系和地面系克制，因此建议携带水系或格斗系宝可梦，例如杰尼龟或腕力。道馆内设有多个落差区域，需要合理利用跳跃机制前进。击败小刚后，玩家将获得灰色徽章，并解锁“闪光”技能，可用于野外探险。
接下来是尼比森林的道馆，不过在《金版》中实际为华蓝市的道馆，由使用水系宝可梦的小霞镇守。该道馆布局较为简单，但需注意水流机关的阻挡。馆主小霞派出的宝可梦包括杰尼龟、宝石海星和实力强劲的美人鱼。由于水系易被电系与草系克制，因此携带雷电球或穿山王（地面系）会是不错的选择。击败小霞后，玩家将获得蓝色徽章，并解锁“冲浪”技能，可在特定水域自由行动。
第三个挑战是尼比森林中的道馆，但实际为浅红市的道馆，由使用毒系宝可梦的小次郎镇守。此道馆布满红色与蓝色按钮，玩家需按照正确顺序踩踏，否则会被传送回起点。小次郎的毒刺水母和双毒刺是其主力，建议使用超能力系或地面系宝可梦进行对抗。通关后，玩家获得粉色徽章，同时解锁“碎岩”技能，可用于破坏特定障碍。
第四个道馆位于尼比森林之后的尼比市，实际为尼比森林后的尼比市道馆，此处应为尼比森林之后的尼比市道馆，不过在《金版》中实际为尼比森林后的道馆为火箭队总部，因此第四个正式道馆应为尼比森林后的尼比市道馆，由使用电系宝可梦的马志士镇守。此道馆布满电网地板，玩家需按照正确路径前进，避免触电。马志士的雷电球与雷丘是电系强敌，建议携带地面系宝可梦如穿山王或大钳蟹。击败马志士后，玩家获得黄色徽章，并解锁“飞行”技能，可随时返回已访问过的城市。
第五个道馆是金黄市的超能力系道馆，由娜姿镇守。娜姿擅长使用梦幻、勇吉拉等超能力系宝可梦，因此建议携带虫系、恶系或幽灵系宝可梦进行对抗。道馆内设有多位训练家，玩家需逐一击败才能挑战娜姿。通关后获得银色徽章，并解锁“念力”技能，可提升宝可梦的特攻。
第六个道馆位于琥珀塔，实际为彩虹市的道馆，由使用冰系宝可梦的希巴镇守。此道馆结构复杂，需利用滑冰机制在冰面上移动。希巴的白海狮与冰鬼护是其主力，建议携带火系或格斗系宝可梦进行克制。击败希巴后，玩家获得靛蓝徽章，并解锁“暴风雪”技能，可在战斗中使用强力冰系招式。
第七个道馆是浅红市的道馆，由使用格斗系宝可梦的坂木镇守。此道馆布局简单，但训练家众多，建议提前准备充足回复道具。坂木的豪力与飞腿郎是其主力，建议使用超能力系或飞行系宝可梦进行对抗。通关后获得灰色徽章，并解锁“地震”技能，可对地面系敌人造成巨大伤害。
最后一个道馆是尼比森林后的尼比市道馆，实际为尼比森林后的火箭队总部，因此第八个正式道馆应为彩虹市的道馆，由使用龙系宝可梦的阿吉镇守。此道馆训练家以龙系为主，建议携带冰系或龙系克星进行对抗。阿吉的哈克龙与快龙是其主力，建议使用冰系技能如暴风雪进行克制。通关后获得金色徽章，并解锁“龙之舞”技能，可大幅提升速度与攻击力。
